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piocca
Nuovo Arrivato
10 Messaggi |
 Inserito il - 03 agosto 2016 : 14:02:15
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Ciao a tutti!
Ho un problema: devo esprimere statisticamente delle ipotesi sulla base di alcuni dati che ho, vi metto qui una tabella:
Immagine:
51,64 KB
-L'ID identifica il topo
-La colonna "Capillaria" si riferisce alla presenza o meno di un parassita nello stomaco di quel topo (0/1)
-Le colonne Lactobacilli/Helicobacter sono il numero di reads riferiti alle OTUs in ciascuno stomaco
Io voglio verificare che:
- La presenza di Capillaria è correlata con elevata carica di Helicobacter
- La carica di Helicobacter è inversamente correlata con la carica di Lactobacilli
Mi è stato detto di usare indici statistici e GLM (general linear model), ma io non so neanche di cosa si tratta e da dove iniziare, so solo che dovrei usare la piattaforma "RStudio", che ho scaricato sul computer.
Vi ringrazio tantissimo se qualcuno può darmi una mano
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Glubus
Utente Junior
156 Messaggi |
Inserito il - 08 agosto 2016 : 09:07:12
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Ciao, Piocca
Anzitutto: si tratta di dati reali o di un esercizio?
Correttamente ti è stato suggerito (da chi?) di utilizzare un GLM (Generalized Linear Model) ed in particolare qui dovresti utilizzare la regressione logistica.
R (e R studio) sono strumenti certamente idonei (come molti altri software) ma non sufficienti a produrre risultati utili oppure anche solamente sensati. Per questo è necessaria una comprensione accurata delle metodiche da utilizzare e della teoria che sottointendono.
Credo che dovresti chiedere aiuto ad uno statistico, in particolare se si tratta di dati reali e non di un esercizio.
GB
Citazione:
Messaggio inserito da piocca
Ciao a tutti!
Ho un problema: devo esprimere statisticamente delle ipotesi sulla base di alcuni dati che ho, vi metto qui una tabella:
Immagine:
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-L'ID identifica il topo
-La colonna "Capillaria" si riferisce alla presenza o meno di un parassita nello stomaco di quel topo (0/1)
-Le colonne Lactobacilli/Helicobacter sono il numero di reads riferiti alle OTUs in ciascuno stomaco
Io voglio verificare che:
- La presenza di Capillaria è correlata con elevata carica di Helicobacter
- La carica di Helicobacter è inversamente correlata con la carica di Lactobacilli
Mi è stato detto di usare indici statistici e GLM (general linear model), ma io non so neanche di cosa si tratta e da dove iniziare, so solo che dovrei usare la piattaforma "RStudio", che ho scaricato sul computer.
Vi ringrazio tantissimo se qualcuno può darmi una mano
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