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fedexa
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35 Messaggi

Inserito il - 10 luglio 2013 : 10:45:34  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di fedexa Invia a fedexa un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciaooo!! Dato il fatto che mi viene un'interferenza negativa immagino di aver sbagliato qualcosa:

(forse ho sbagliato proprio qui ad impostarlo) Ho dato per scontato che dove mi dava una singola informazione di una mutazione il resto fosse ++(es: occhio marrone = + + bb /+ + bb)

Ho indicato come parentali 1) wild type e 2) occhio marrone corpo nero ali sfrangiate

Doppi ricombinanti= 1) ali sfrangiate e 2) occhio marrone e corpo nero

l'ordine dei geni mi è venuto: bw--sw---bb
con distanze bw-sw=22.5 um e sw--bb=22.2um

però il c.o.c mi viene maggiore di 1!!

se ho sbagliato l'impostazione potreste indirizzarmi? grazie mille



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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8397 Messaggi

Inserito il - 10 luglio 2013 : 11:58:50  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
L'interferenza può anche essere negativa!
Non ho voglia di riscrivere, mi autocito
Citazione:
Messaggio inserito da GFPina
da: http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=21677

Comunque l'interferenza (come comprensibile anche dal nome) è semplicemente il fenomeno per cui se avviene un C.O. in una regione questo può "influenzare" (interferire) il verificarsi di C.O. nelle regioni vicine.
L'interferenza può essere positiva o negativa.
interferenza positiva: la frequenza di doppi C.O. è diminuita rispetto all’atteso
interferenza negativa: la frequenza di doppi C.O. è aumentata rispetto all’atteso

Si definisce coefficiente di coincidenza il rapporto tra le frequenze osservate e le frequenze attese dei doppi ricombinanti:
c = fr.DR oss/fr.DR att
l'interferenza è:
I = 1-c
quindi se l'interferenza è = 1 non ci saranno doppi ricombinanti
se l'interferenza è = 0 ci saranno i doppi ricombinanti attesi.

Quindi ovviamente l'interferenza è la CAUSA del diverso numero di DR, non vice versa!


Ci sono però due errori in quello che hai scritto.

Citazione:
Ho dato per scontato che dove mi dava una singola informazione di una mutazione il resto fosse ++(es: occhio marrone = + + bb /+ + bb

sì l'informazione è sulla mutazione e il resto è w.t. quindi +, però attenzione che è la progenie di un reincrocio, come sarà il secondo cromosoma (quello ereditato del maschio omozigote recessivo)?

Citazione:
con distanze bw-sw=22.5 um e sw--bb=22.2um

a me le distanze vengono diverse, prova a rivedere i conti!
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fedexa
Nuovo Arrivato



35 Messaggi

Inserito il - 10 luglio 2013 : 20:35:32  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di fedexa Invia a fedexa un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ah ok ..

quindi ad esempio occhio marrone sarà + + bw / bw sw bb ???

poi ho ricontrollato i conti e mi vengono uguali quindi devo aver sbagliato a prendere i ricombinanti
le distanze io l'ho calcolate con:
F.r. tra bw--sw = 221+258+97+99/3000=0.225
F.r. tra sw--bb = 255+216+97+99/3000=0.222
dove sbaglio?
P.S =grazie infinite sempre per l'aiuto giornaliero
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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8397 Messaggi

Inserito il - 11 luglio 2013 : 10:43:02  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sì hai sbagliato a prendere i ricombinanti!
I doppi ricombinanti sono:
ali sfrangiate               97
occhio marrone e corpo nero  99

e qua ci siamo!
Ma per i singoli ricombinanti li hai mischiati, tu hai messo assieme:
ali sfrangiate e corpo nero      221
ali sfrangiate e occhio marrone  258

e
corpo nero                       255
occhio marrone                   216


a parte il fatto che volendo si vede anche dai numeri che sono sbagliati (i ricombinanti della stessa classe avranno numeri simili!),
ma comunque le due classi devo essere complementari.
Ad es. se tu hai questo cromosoma:
  A    B    C 
______________
  a    b    c

se avviene ricombinazione tra A e B avrai:
  A    b    c    e     a    B    C 

mentre se avviene ricombinazione tra B e C avrai:
  A    B    c    e     a    b    C 


non puoi mischiarli e mettere:
  a    B    C   con     A    B    c 

hanno entrambi l'allele B e nessuno dei due ha b!
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