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edoardo
Nuovo Arrivato


Prov.: Roma


2 Messaggi

Inserito il - 02 marzo 2006 : 15:57:32  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di edoardo Invia a edoardo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
aiuto devo affrontare l'esame di biologia molecolare 2.
il mio docente mi ha dato solo delle dispense esiste un libro che tratti questi argomenti ?

aiutatemi per favore come si fa a preparare un esame su un monitor solo con delle dispense ... posseggo gia il libro biologia molecolare weaver ma non tratta specificamente questi temi.

• Produzione delle estremità 3’ degli mRNA
- La poliadenilazione
- Identificazione sequenze consensus, confronti filogenetici e mutazioni.
- Uso di RNA marcati ed estratti per analizzare il processo in vitro; frazionamento/purificazione fattori
- Subunità che legano l’RNA – analisi della specificità di legame (band shifts/competizioni)
- identificazione per omologia dei geni di lievito, mutanti condizionali e studio della loro funzione (estratti di lievito mutati per singoli componenti)
• Regolazione della formazione delle estremità 3’ degli mRNA:
- poliadenilazione alternativa nei geni delle immunoblobuline
- proteina NS1 del virus dell’influenza –
- controllo autogeno della proteina U1A a livello di poliadenilazione (identificazione siti di legame sul trascritto primario di U1A, uso di estratti per dimostrare che effetto su poliadenilazione e non taglio, mutanti di U1A che legano ma non reprimono, interazione con Pap)
• Produzione dell'estremità 3' degli mRNA per gli istoni – lo snRNA U7
- esperimenti di microiniezioni in oociti di Xenopus di geni per gli istoni di riccio - tentativi di complementazione con proteine/cDNA/poli-A- RNA
- sequenza di U7 e complementarietà con 3’ UTR degli mRNA per gli istoni
- mutazioni su 3’ UTR e soppressione con mutanti in U7 snRNA
• Produzione delle estremità 3’ di piccoli RNA non codificanti
- I precursori degli snRNA non vengono poliadenilati
- Disaccoppiamento tra taglio e poliadenilazione
- Importanza dell’assemblaggio co-trascrizionale per la corretta terminazione/processamento dei trascritti nascenti
• Lo splicing e i piccoli RNA nucleari
- Interazioni RNA/RNA e riarrangiamenti strutturali nella formazione dello “spliceosome” attivo.
- identificazione importanza del 5’ di U1 (mutanti 5’ss e soppressori in U1 - RNasiH) e di U2 in lievito (mutanti in branch site e soppressori in U2)
- cambiamenti conformazionali (U6 su 5’ ss, U5 su esoni)
- interazione U6/U4 e U6/U2 (analisi filogenetica di conservazione di sequenza e coevoluzione U6/U4/U/2
• Regolazione dello splicing alternativo :
- proteina ribosomale L32 in lievito –
- identificazione che la regolazione opera a livello di splicing e che la proteina è l’effettore della regolazione
- identificazione delle sequenze coinvolte nella regolazione (sequenze conservate filogeneticamente, 5’SS non-canonico)
- mutazioni che rilasciano il controllo
- analisi in vitro del legame della proteina sul proprio pre-mRNA e analisi dell’interferenza con lo splicing
• Autosplicing (introni di gruppo I e II)
- Identificazione che il pre-rRNA di T.thermophila è in grado di fare autosplicing
- Intermedi di splicing e richiesta del cofattore guanosinico
- Reazione di transesterificazione
- Identificazione introni gruppo II
- Importanza della presenza degli introni nell’evoluzione dei geni eucariotici (aumento frequenza ricombinazione e funzionalità del prodotto di ricombinazione)
- Geni e genomi senza introni
• Correlazioni evolutive tra splicing nucleare e autosplicing (conservazione domini di interazione snRNA pre-mRNA e domini introni di gruppo II: U2/U6/BS – U5/siti di splicing)
Stabilità dell’RNA
- deadenilazione e decapping,
• mRNA factory
• –accoppiamento tra trascrizione e processi post-trascrizionali (capping, splicing, trasporto e formazione delle extremità 3’)
- esperimenti per verificare che enzimi di capping interagiscono solo con CTD-P (Ippt)
- copurificazione di 160 KD con TFIID
- esperimenti per dimostrare che 160 KD di CPSF interagisce con TFIID e solo dopo l’inizio della trascrizione si associa al CTD-P (Ippt e western)
- CSPF 160 kD non viene reclutata su promotori di istoni
- identificazione di Aly e TAP (importanza per l’esporto) e loro reclutamento durante lo splicing (interazione con UAP 56)


aiuto! vi prego ho bisogno di voi!

quoth the raven nevermore!

dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi

Inserito il - 02 marzo 2006 : 19:01:54  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Io di biologia molecolare ho il 'Weaver - Molecular Biology' della McGraw-Hill... A occhio e croce ci sono una buona parte di questi argomenti.
Ti conviene studiare sulle review pero'... e' difficile trovare un libro che tratti di tutte queste cose..

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
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Jarod99
Nuovo Arrivato

DNA_



78 Messaggi

Inserito il - 03 marzo 2006 : 19:45:31  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Jarod99  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Jarod99 Invia a Jarod99 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Io ti consiglio "il Gene VI" ( o comunque l'ultima edizione in italiano) di Lewin. In certi argomenti completa il Weaver.
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vinta
Nuovo Arrivato

Prov.: Piacenza
Città: Piacenza


81 Messaggi

Inserito il - 04 marzo 2006 : 01:20:55  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di vinta  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da Jarod99

Io ti consiglio "il Gene VI" ( o comunque l'ultima edizione in italiano) di Lewin. In certi argomenti completa il Weaver.



E' uscita da poco la traducione del gene VIII a opera di Zanichelli.

Young Scientist, yet another science blog

http://yscientist.blogspot.com
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GfCampione
Nuovo Arrivato


Prov.: Palermo
Città: Perugia


36 Messaggi

Inserito il - 07 marzo 2006 : 18:39:23  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GfCampione  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GfCampione  Invia a GfCampione un messaggio Yahoo! Invia a GfCampione un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Prendi il Gene VIII, costa un po' ma c'è davvero tutto....
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edoardo
Nuovo Arrivato


Prov.: Roma


2 Messaggi

Inserito il - 15 marzo 2006 : 21:26:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di edoardo Invia a edoardo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie ragazzi , siete stati fantastici. grazie .

quoth the raven nevermore!
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P.M.
Nuovo Arrivato



35 Messaggi

Inserito il - 20 luglio 2006 : 11:04:31  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di P.M. Invia a P.M. un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Edoardo cos'è Ippt????ho l'esame domani!!!
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magronotturno
Nuovo Arrivato



4 Messaggi

Inserito il - 09 gennaio 2008 : 12:36:49  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di magronotturno Invia a magronotturno un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ma... come avere fatto a trovare quegli argomenti sul Gene VIII ??? Bisogna fare quasi tutto sulle review ?? Possibile ??

Ad esempio "Proteina NS1 e blocco di CPSF" sul Lewin dove sta ????? AIUTOOOOOOOOOOO !!!!
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Aureus
Utente Junior

0613_da_Fil23

Prov.: Forlì-Cesena
Città: Gambettola


123 Messaggi

Inserito il - 09 gennaio 2008 : 14:24:04  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Aureus  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Aureus Invia a Aureus un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Prova anche a guardare "Genomi II" se ti scompiffera..
...troverai utili informazioni per la preparazione

T.A.Brown
Ciao ciao

www.tlbspazio.it

Tecnici di Laboratorio Biomedico
Lorenzo Nardi
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magronotturno
Nuovo Arrivato



4 Messaggi

Inserito il - 10 gennaio 2008 : 12:44:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di magronotturno Invia a magronotturno un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ok, lo sto scaricando.. però sono pessimista, la maggior parte delle review sono a pagamento.. uff..

grazie cmq :)

Chi vale vola, chi non vale non vola, chi vale e non vola è un vile..
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Muster
Nuovo Arrivato



8 Messaggi

Inserito il - 18 novembre 2008 : 13:27:53  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Muster Invia a Muster un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ragazzi, una domanda da "niubbo" che cosa è una review???
Scusate l'iNNioranza
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Giuliano652
Moderatore

profilo

Prov.: Brescia


6811 Messaggi

Inserito il - 18 novembre 2008 : 14:11:42  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Giuliano652 Invia a Giuliano652 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da Muster

ragazzi, una domanda da "niubbo" che cosa è una review???
Scusate l'iNNioranza



I libri di testo sono la semplificazione e la somma di quelle che vengono chiamate review, che a loro volta sono degli speciali articoli che danno "lo stato dell'arte" riguardo ad un certo argomento. Diciamo che più articoli fanno una review e più review fanno uno o più capitoli di un testo. Ovviamente quando dico "più articoli" o "più review" non intendo semplicemente un elenco di queste cose, ma vengono lette, studiate, riassunte e riscritte in modo da mettere insieme tutte le informazioni

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