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Mat
Nuovo Arrivato
85 Messaggi |
 Inserito il - 09 dicembre 2009 : 17:21:11
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Qualcuno mi sa spiegare cos'è la tecnica ChIP?
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Giuliano652
Moderatore
Prov.: Brescia
6940 Messaggi |
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Bio_Noob
Nuovo Arrivato
14 Messaggi |
Inserito il - 15 dicembre 2009 : 11:00:21
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| chip sta per CHromatin ImmunoPrecipitation, è un metodo di ricerca utilizzato in Epigenetica per determinare i geni soggetti a imprintig. Dal momento che l'imprintig consiste nella metilazione di citosine nei geni che si sono "imprinti", chip (che sono ANTICORPI) si legano alle citosine metilate facendole precipitare. Cosi in seguito si può riconoscere di che geni si tratta, ad esempio facendo microarray |
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Giuliano652
Moderatore
Prov.: Brescia
6940 Messaggi |
Inserito il - 15 dicembre 2009 : 11:24:13
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Citazione:
Messaggio inserito da Bio_Noob
chip (che sono ANTICORPI)
chip sono anticorpi? 
Io l'ho usata per studiare la cinetica di legame di un fattore di trascrizione sul DNA, facendo il ChIP assay a tempi diversi. Molto in sintesi: si prendono le cellule e si stimolano in qualche modo, poi si fissano a tempi diversi. Si frammenta il DNA con le proteine legate, si fa una immunoprecipitazione per le proteine e si selezionano quelle in esame legate ai frammenti di DNA, poi si separano i frammenti dalle proteine, si fa una PCR e si amplifica il frammento per verificare che ci sia stato o meno il legame.
In effetti si può usare anche in epigenetica per verificare le metilazioni sul DNA, ma "chip (che sono ANTICORPI)" è una frase senza senso: ChIP come dici correttamente prima sta per chromatin immunoprecipitation, ovvero immunoprecipitazione della cromatina: si prendono degli anticorpi contro qualcosa (citosine metilate o fattori di trascrizione che siano) e si fanno reagire col DNA per selezionare dei frammenti, successivamente si fa una PCR per verificare che quei frammenti esistano, tutto qui. |
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