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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
 Inserito il - 08 gennaio 2012 : 16:43:59
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Ciao a tutti,
vi segnalo questo corso introduttorio alla Programmazione e alla Bioinformatica per Biologi Evolutivi.
-> Programming for Evolutionary Biology Course
Io sarķ uno degli istruttori del corso :-), dando una lezione sugli ambienti Unix. In ogni caso, alla fine del corso metteremo tutto il materiale delle lezioni a disposizione online.
La deadline č il 31 gennaio 2012, e per applicare č sufficente una carta di motivazione ed una lettera di raccomandazione. Penso che tutto il materiale sia giá sul sito, ma se avete domande potete chiedere direttamente a me tramite questo forum.
saluti e buon molecularlab a tutti :-)
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Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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Giuliano652
Moderatore
Prov.: Brescia
6940 Messaggi |
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0barra1
Utente Senior
Cittā: Paris, VIIčme arrondissement
3847 Messaggi |
Inserito il - 08 gennaio 2012 : 21:26:31
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| Mi pare di no, ma provo ugualmente a chiedere: come M2 student posso partecipare? |
So, forget Jesus. The stars died so that you could be here today.
A Universe From Nothing, Lawrence Krauss
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
Inserito il - 09 gennaio 2012 : 13:15:53
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Citazione:
Messaggio inserito da 0barra1
Mi pare di no, ma provo ugualmente a chiedere: come M2 student posso partecipare?
Ciao 0barra,
con "M2 student" ti riferisci a che sei uno studente di laurea specialistica al secondo anno?
In principio, il corso č orientato a studenti di dottorato e postdocs, perō se sei interessato ti consiglio di provare ad applicare in ogni caso. Se vuoi, nella carta di motivazione puoi scrivere che sei uno studente di master e che hai trovato l'annuncio su molecularlab, cosí per noi sará piú facile risalire a te e a questa discussione.
In genere questo tipo di corsi a pagamento viene frequentato da studenti di dottorato o post-docs finanziati da un laboratorio. Il problema principale č che se sei uno studente di master, probabilmente non avrai nessun laboratorio alle spalle disponibile a pagarti la matricola e le spese di viaggio, e quindi dovrai affrontare le spese per tuo conto. Forse ti conviene aspettare un anno, ed applicare una volta che tu abbia un laboratorio disposto a finanziarti. Anche se dall'altro lato, abbiamo alcune borse di studio disponibili per studenti senza fondi, ed č anche vero che corsi come questo sono una buona opportunitá di conoscere gente e di trovare contatti per un dottorato.
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0barra1
Utente Senior
Cittā: Paris, VIIčme arrondissement
3847 Messaggi |
Inserito il - 10 gennaio 2012 : 16:31:20
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Si, usavo la terminologia di qui, ci hai azzeccato in pieno: studente al secondo anno.
Grazie della tua cortese risposta, in realtā la mia era pių che altro una curiositā: purtroppo il poco tempo lasciato agli studenti per la preparazione della tesi sperimentale non mi consente neppure di stoppare gli esperimenti per due settimane intere, ne parlavo oggi con il mio PI. Mi interessava tuttavia visto che, sebbene la biologia evolutiva non sia esattamente il mio campo (o forse proprio per questo), mi occupero' di una proteina seguendo la sua localizzazione subcellulare lungo un bell'arco evolutivo.
E' una buona cosa che si ripeta il prossimo anno: certamente faro' la mia application.
Peccato perdermi la tua lezione!
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giuliocata
Nuovo Arrivato
3 Messaggi |
Inserito il - 11 gennaio 2012 : 18:56:38
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Ciao
stavo cercando un corso sulla gestione ed elaborazione dei dati next generation sequencing ed ho notato proprio ieri questo qui di lipsia. Mi sembra di capire perō che affronta vari aspetti della biologia computazionale.
Me lo consigliersti lo stesso? Non ho nessuna conoscenza di linux, perl e R.
La quota di partecipazione č abbastanza alta se non č coperta dalla borsa di studio..
quali sono i criteri per l'assegnazione della borsa??
Grazie
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
Inserito il - 16 gennaio 2012 : 11:15:12
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Ciao Giulio,
che io sappia, il corso migliore per imparare Next Generation Sequencing Analysis č la NGS summer school in cui insegnano Titus Brown e Albert Istvan: http://bioinformatics.msu.edu/ngs-summer-course-2012
Il problema č che si tratta di un corso molto ambito, ed č difficile entrare. Inoltre, č piú caro del corso che abbiamo organizzato a Lipsia, ed anche piú lontano.
C'č anche un corso organizzato da EMBL (http://www.wellcome.ac.uk/Education-resources/Courses-and-conferences/Advanced-Courses-and-Scientific-Conferences/Advanced-Courses/WTX056918.htm ) perķ richiede avere qualche conoscenza di Linux.
Il corso organizzato a Lipsia č pensato per persone che non abbiamo molta esperienza con la programmazione e con i sistemi Unix, e che abbiamo bisogno di un primer per iniziare. Ci sono almeno 25 ore dedicate a spiegare le basi di Linux, R, Perl e Bioperl, con molte esercitazioni. Se non hai nessuna esperienza con questi argomenti, ti potrebbe essere utile in ogni caso...
La parte dedicata all'analisi di NGS non č molto grande, perķ ci saranno almeno 4 ore di lezione dedicate ad introdurre gli strumenti base per NGS e altre 4 ore per spiegare come analizzare variazioni strutturali (come inversioni cromosomiche e duplicazioni). Inoltre, č previsto che ogni studente proponga un piccolo progetto personale, da svolgere nell'ultimo giorno del corso e con l'aiuto di tutti gli istruttori: potresti presentare un progetto di NGS, e ti aiuteremo con l'analisi.
E' vero che il corso costa 300 euro, perķ considera che la maggior parte dei corsi simili costa di piú. Inoltre, il prezzo include anche l'hotel, la cena ed i caffé per le pause... E se ne hai bisogno, puoi anche richiedere una borsa di studio per il viaggio.
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
Inserito il - 16 gennaio 2012 : 11:21:38
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ok, ho ricevuto risposta dalla organizzatrice in merito alla borsa di studio. In primo luogo, il contributo di 2400 euro della Volkswagen foundation sará uguale per tutti: ovvero, il costo del corso č 300 euro per persona, tutto incluso.
Per il resto, la borsa di studio per il viaggio verrá data in base a quante persone la chiederanno e al loro bisogno. Per esempio, sará importante spiegare se il tuo laboratorio ha fondi per finanziarti il viaggio, e se hai la possibilitá di richeidere altre borse di studio per il corso. Non sappiamo ancora quante persone chiederanno la borsa di studio e quali saranno le esigenze, perķ alla fine cercheremo di distribuire le risorse in maniera equa affinchč tutti possano partecipare.
Per quanto riguarda la parte di Next Generation Sequencing, in totale ci saranno una lezione su SNP calling ed una sulle Variazioni Strutturali da parte di Tomas Marques, ed altre lezioni su RNA-Seq e su ChIP Sequencing... piú o meno un quarto del corso. Il resto delle lezioni, a parte le lezioni di programmazione, saranno dedicate alle API di Ensembl e alla filogenomica. |
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giuliocata
Nuovo Arrivato
3 Messaggi |
Inserito il - 16 gennaio 2012 : 13:15:21
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Ok molto chiaro!
Non penso di poter usufruire di borse di studio anche perchč finito il postdoc a bcn adesso lavoro con il mio prof di palermo a gratis..posso richiedere una borsa per le spese del viaggio?
Deve essere il mio prof a scrivere una lettera in cui dice di non avere i fondi per finanziarmi?
Ad ogni modo penso di inviarvi la mia application a breve. Ho conosciuto Tomas Marques a bcn e mi ha fatto un'ottima impressione.
ciao giovanni
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
Inserito il - 16 gennaio 2012 : 22:48:55
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Bene! Mi fa piacere che ti interessi il corso.
Per la borsa di studio, se puoi chiedere al tuo capo di commentare il problema nella lettera di raccomandazione. In ogni caso, non ti preoccupare, ti crediamo :-).
Se vuoi, scrivi nella lettera di raccomandazione che hai trovato l'offerta su molecularlab, cosí sapremo che si tratta di te.
saludos y a presto!
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giuliocata
Nuovo Arrivato
3 Messaggi |
Inserito il - 18 gennaio 2012 : 15:12:59
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Ho applicato (perō non ho fatto riferimento a molecularlab) ! Ho una domanda per te..in base a cosa vengono selezionati i partecipanti al corso? Il CV non č tra i documenti richiesti..
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Programming for Evolutionary Biology Course - Leipzig 2012
