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 Com'è fatta una molecola e i suoi legami
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lollof.92
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56 Messaggi

Inserito il - 20 giugno 2013 : 11:19:21  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lollof.92 Invia a lollof.92 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti. Sto preparando chimica organica e all'inizio del libro c'è la parte "generale" in cui si parla anche dei legami chimici. Mi interessa molto la parte della struttura di una molecola, dei suoi legami etc... E' interessante anche l'ibridizzazione, i legami sigma e pi greca & Co.
Queste cose, in quale corso si studierebbero? Perchè in chimica generale al primo semestre le abbiamo fatte ma molto velocemente.

Giuliano652
Moderatore

profilo

Prov.: Brescia


6940 Messaggi

Inserito il - 20 giugno 2013 : 11:20:44  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Giuliano652 Invia a Giuliano652 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
di che corso di laurea parliamo?

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lollof.92
Nuovo Arrivato



56 Messaggi

Inserito il - 20 giugno 2013 : 11:21:48  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lollof.92 Invia a lollof.92 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Io sono a Biotecnologie, ma intendo in senso generale. Ho usato il condizionale per quello!
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 20 giugno 2013 : 17:54:24  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Per entrare nel dettaglio ti consiglierei un corso o un libro di fisica chimica probabilmente.

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lollof.92
Nuovo Arrivato



56 Messaggi

Inserito il - 20 giugno 2013 : 17:57:00  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lollof.92 Invia a lollof.92 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao! Grazie per l'aiuto: anche io pensavo a chimica fisica, ma ho visto che nei corsi di laurea dove c'è chimica fisica I e II, nel primo si parla di termodinamica e nel secondo di quantomeccanica, quindi ho aspettato prima di prendere un qualsiasi libro...
Vorrei anche essere sicuro di poter capire, almeno i concetti fondamentali senza la formulazione matematica, quello che leggo (quindi vorrei sapere i prerequisiti).
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kORdA
Utente Attivo

newkORdA

Prov.: Milano
Città: Monza


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Inserito il - 20 giugno 2013 : 17:57:04  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kORdA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kORdA Invia a kORdA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Scritto da MolecularLab Mobile

Se sei a biotech e stai preparando chimica organica dubito che ne sentirai mai più parlare. Forse se prendi un indirizzo farmaceutico se ne potrebbe riparlare in chimica farmaceutica, oppure in biotech industriali se vengono toccati argomenti di catalisi enzimatica...

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada
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lollof.92
Nuovo Arrivato



56 Messaggi

Inserito il - 20 giugno 2013 : 17:58:27  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lollof.92 Invia a lollof.92 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ma se poi volessi proseguire gli studi verso qualcosa di più chimico (se posso) e magari studiare QSAR o dinamica molecolare? Li dovrei sentirne riparlare?
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kORdA
Utente Attivo

newkORdA

Prov.: Milano
Città: Monza


1303 Messaggi

Inserito il - 20 giugno 2013 : 17:59:27  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kORdA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kORdA Invia a kORdA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Scritto da MolecularLab Mobile

Si fa quantomeccanica nella triennale? Great!

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada
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lollof.92
Nuovo Arrivato



56 Messaggi

Inserito il - 20 giugno 2013 : 18:00:34  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lollof.92 Invia a lollof.92 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
No no, cioè non a Biotech! Ma a Chimica (triennale) ho visto che hanno Chimica Fisica I e II e a II ho letto meccanica quantistica...
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kORdA
Utente Attivo

newkORdA

Prov.: Milano
Città: Monza


1303 Messaggi

Inserito il - 20 giugno 2013 : 18:07:29  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kORdA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kORdA Invia a kORdA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Scritto da MolecularLab Mobile

Lascia perdere i chimici, sono una brutta razza, soprattutto quelli che si occupano di quantum :-)
La chimica computazionale la trattano bene dalle parti di CTF (aka Chimica e Tecnologie Farmaceutiche), che tra l'altro sono un po' più vicini ad un biotech di estrazione

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada
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kORdA
Utente Attivo

newkORdA

Prov.: Milano
Città: Monza


1303 Messaggi

Inserito il - 20 giugno 2013 : 18:08:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kORdA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kORdA Invia a kORdA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Scritto da MolecularLab Mobile

Ehm... forse sono un po' di parte

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada
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lollof.92
Nuovo Arrivato



56 Messaggi

Inserito il - 20 giugno 2013 : 18:09:21  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lollof.92 Invia a lollof.92 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ma chimica computazionale è chimica quantistica sono la stessa cosa??
Io vorrei solo sapere dove posso approfondire la struttura delle molecole ed i legami... (Per il momento!!)
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kORdA
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newkORdA

Prov.: Milano
Città: Monza


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Inserito il - 21 giugno 2013 : 11:20:30  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kORdA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kORdA Invia a kORdA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
La chimica quantistica è una disciplina perlopiù teorica. La chimica computazionale è una disciplina applicativa che spazia da simulazioni di meccanica molecolare alla costruzione di modelli di omologia, al drug design, al docking. Avevo letto nel thread che parlavi di QSAR: a parte i concetti di base dominio della chimica computazionale.

La chimica computazionale abbraccia pure i risvolti pratici di calcolo della chimica quantistica. Insomma, la teoria sta ai fondamenti di termodinamica e quantum quanto i calcoli stanno alla chimica computazionale.

Poi... personalmente non apprezzo molto il concetto di "computazionale" di molta gente che fa questo mestiere. Intendo dire, è molto più presa dall'aspetto scientifico in sè che non dall'approccio metodologico. Molti chimici "computazionali" usano l'informatica per fare solo number crunching stile vecchia scuola.

Ci sono ancora programmi scritti in un Fortran stra-obsoleto. E mi è capitato più di una volta sentirli lamentare che le macchine a disposizione (cluster di GPU, non rottami) non sono sufficientemente performanti. Forse dovrebbero cambiare mentalità, pensando che sono i loro programmi a doversi adattare/aggiornare alle nuove piattaforme di calcolo, non il contrario.

e scusate lo sfogo...

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada
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lollof.92
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Inserito il - 21 giugno 2013 : 13:05:34  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lollof.92 Invia a lollof.92 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ok quindi credo di aver capito che dovrei orientarmi più sul lato chimica computazionale... Ma la domanda ora è: come ci arrivo? Cioè quali sono i "pre-requisiti" per poterla studiare?
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kORdA
Utente Attivo

newkORdA

Prov.: Milano
Città: Monza


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Inserito il - 21 giugno 2013 : 14:49:14  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kORdA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kORdA Invia a kORdA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
I due moduli di chimica-fisica a cui accennavi potrebbero rappresentare il background nozionistico necessario probabilmente. Poi dipende, se tu decidessi di prendere la strada specialistica in biotech industriali o farmaceutiche probabilmente riprenderai l'argomento.

Sul fronte pratico credo che un corso base di bioinformatica sia un buon punto di partenza. Non so dove stai studiando, ma grosso modo quasi tutti i CdL di biotech hanno un corso introduttivo di bioinformatica. La mia sensazione è che il bioinformatico sia più formato verso l'omica e le banche dati biologiche che non verso la chimica computazionale (che pare invece appannaggio di chimici, fisici e CTF). Quindi ti consiglierei di cercare eventualmente un corso che dia qualche CFU, ma non di intraprendere la specializzazione in bioinfo.

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada
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lollof.92
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Inserito il - 21 giugno 2013 : 15:36:21  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di lollof.92 Invia a lollof.92 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie. Purtroppo da me Bioinformatica non si fa (-_-), ma ho iniziato qualche settimana fa a leggere un libro da solo (il Pascarella) e devo dire che a parte gli ultimi 3 capitoli alla fine, il resto è banche dati e non mi piace! Pensavo di prendere un MSc in Bioinformatica ma dopo questo penso proprio di cambiare strada. Scusa ma non ho capito l'ultima frase...
Quindi per studiare molecular dynamics, molecular quantum mechanics, qsar e molecular mechanics ho prima bisogno di chimica-fisica?
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kORdA
Utente Attivo

newkORdA

Prov.: Milano
Città: Monza


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Inserito il - 21 giugno 2013 : 16:44:49  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kORdA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kORdA Invia a kORdA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da lollof.92

Quindi per studiare molecular dynamics, molecular quantum mechanics, qsar e molecular mechanics ho prima bisogno di chimica-fisica?



beh, si... come pretendi di fare molecular dynamics senza avere una base di termodinamica?! Qualsiasi smanettone sarebbe in grado di usare GROMACS, ma se non sa dove guardare o cosa significano le analisi che sta facendo ha solo prodotto un bel filmatino di una molecola in una scatola d'acqua.


http://www.linkedin.com/in/dariocorrada
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