Bioinformatica e Web 2.0

Inside Bioinfo

30 gennaio 2008 - 17:37

La proprietà transitiva della Bioinformatica

La bioinformatica ha speso negli anni molti sforzi intorno il pattern detection, per ovvii motivi. Il pattern matching è infatti una delle grandi anime della bioinformatica; è usato, dove più dove meno, ovunque, negli allineamenti multipli, nel homology modeling, per classificazioni e per predizioni, in proteomica come in genomica.
Non è una notizia nuova che IBM stia applicando con successo alcune tecniche usate in bioinformatica per la ricerca di pattern nel DNA nel campo dell’identificazione dello spam (l’algoritmo Teiresias sviluppato da Chung-Kwei). Daltronde lo stesso George Harik, uno dei primi dieci ingegneri di Google, e che collabora a sistemi “intelligenti” come Adsense e Gmail anti-spam, ha un background che coinvolge algoritmi genetici.

Tutto questo per dimostrare come grandi vantaggi possono venirne dal sapere far tesoro dell’interazione di settori scientifici anche distanti (apparentemente). Naturalmente sarebbe auspicabile una relatione tra bioinformatica e altre scienze che non sia intransitiva.
Un interessante articolo su openHelix circa le difficoltà di navigare, attraverso metodi intelligenti, nel mare magnum
della letteratura scientifica
, mette l’accento (anche) su questo aspetto:

we pointed out that all or most of the demonstrably useful biomedical text mining systemshave been built not by text mining specialists, but by computational biologists. Why might this be? Although this has not been systematically investigated, we speculate that it is related to cultural differences between the two groups.
[...] a combination of computational biologists and text mining specialists will be optimum.
Text mining specialists continue to excel at building system components and designing datasets for evaluation; computational biologists currently appear to be much better at producing useful task definitions. Perhaps the most fruitful approaches are characterized by combined efforts that leverage the abilities of each type of scientist.

Vi consiglio l’articolo da cui partono, o almeno leggere il post su openHelix; tra le altre cose fa il punto sulle risorse web disponibili al momento per “navigare la letteratura”. Devo ammettere che il grafico che disegna il tasso di crescita del numero di abstract è spaventevole, più ancora della crescita del numero di database catalogati nelle tabelle dell’ultimo NAR.

Tags: bioinformatica, Data-mining, Letteratura scientifica, Scienza
17 gennaio 2008 - 11:55

PCR song (La ricerca va a braccetto con la musica)

Ormai esiste una certa tradizione per cui su YouTube non si trovano solo bellissimi video che raccontano le meravigliose minuzie del mondo biologico, ma pare che i ricercatori abbiano anche uno spiccato senso del ritmo (oppure potrebbe essere che hanno un sacco di tempo libero tra uno split di cellule e l’altro :-) ).

Certo è che una mente creativa ama esprimersi in mille modi diversi, e anche quando la scienza assume un aspetto goliardico i risultati sono spesso incredibili! Mi è capitato sotto gli occhi questo piccola chicca.
Have fun!

Immagine anteprima YouTube

 

 

Tags: Musica, Scienza, video, Youtube
2 gennaio 2008 - 13:46

Wired Science: Comunicare la scienza (for dummies)

Eccoci al primo post del nuovo anno!
Anche qui in Inside Bioinfo ci si è dedicati alla giusta pennica per qualche giorno. Ma ora rieccoci più forti e carichi di prima!
Per il nuovo anno un buon proposito che mi piacerebbe venisse adottato da quanta più gente di scienza possibile è la volontà di comunicare la scienza il più semplicemente possibile. Questo è quanto io stesso mi proporrò, collaborando e scrivendo post che si distinguano in due categorie: 1) più tecnici – sempre più particolareggiati 2) più immediati, più intesi a divertire e a comunicare un semplice concetto: la bellezza della scienza!

Perchè è fondamentale che molti di noi si profondano in questo sforzo? Fondamentalmente per motivi egoistici. Per far scienza bene occorrono fondi. Tanti. Occorre quindi che sovvenzioni (che siano statali o meno), donazioni e quant’altro crescano il più possibile. Per far ciò occorre che tutti, anche le persone più comuni recepiscano la ricerca scientifica non come un concetto astratto, ma come un aspetto cruciale per la crescita e la qualità della vita di ogni giorno per ognuno.
Da parte dello scienziato c’è sempre stata un po’ di presunzione nel presupporre che tutti comprendano il fortissimo ruolo che ha la scienza sulla società. E’ sbagliato credere che quanto diverga dalla scienza più pura non debba essere preso seriamente. Questo approccio tende solo ad inasprire le barriere.

La comunicazione con il mondo, come liberi pensatori, deve focalizzarsi su una scienza più accessibile. La nostra capacità di comunicare deve avvenire su molti livelli, come ci insegna spesso Veronesi. Una scienza che sia altamente educativa dovrebbe essere uno dei grandi obiettivi di ognuno.
Questo compromette la qualità della ricerca? Assolutamente no! Occorre solo abbandonare l’arroganza dipica dello scienziato che crede che, per il fatto di avere le evidenze sperimentali dalla propria parte, ognuno debba sottoscrivere il suo punto di vista.
Per questo buon proposito partiamo avantaggiati. Già nel 2007 si sono visti ottimi esempi di SHOW scientifici. Uno per tutti è il programma WiredScience, che produce una trasmissione scientifica d’ottimo livello, ma anche semplice e divertente! Consiglio a tutti di passare un po’ di tempo sulle loro frequenze!

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Buon anno a tutti!

Tags: Comunicare, Scienza, Società, WiredScience
4 dicembre 2007 - 19:08

LOOKING FOR A BUDGET LUXURY WATCH? PRE-OWNED WATCHES ARE FOR YOU

LOOKING FOR A BUDGET LUXURY WATCH? PRE-OWNED WATCHES ARE FOR YOU

You may think that it is impossible to find a luxury watch at an affordable price, however, you would be wrong to think so. You can find time-pieces from even the most prestigious of watch markers at budget-friendly prices when choosing to buy pre-owned. So whether you want to start a watch collection, or are seeking a classy everyday watch, consider going second-hand to make the most out of your budget.
ALL WATCHES

Affordable Luxury Brands
The History Of Rolex

WHAT MAKES A WATCH BE CLASSED AS LUXURY?

In the world of watches, there is a clear distinction between what is considered premium and what is referred to as a standard watch. Luxury watches are all about the precision of the timekeeping, the craftsmanship and the quality of the materials. Even just the brand name can increase a watch’s value! Let’s take a look into all of the features that give luxury watches their status.

Materials
Using cheap plastic or hollow metals is a no-go. All of the materials used in a premium watch must be of high quality and built to last. Expect classic metals such as gold, platinum and stainless steel across the construction of the whole watch, including the lug, the bezel and the case. Watch bracelets are also crafted with high-quality materials, ensuring maximum comfort and longevity. Even a leather bracelet can be used on a luxury watch if the leather is of high quality. The crystal is another consideration in a luxury watch. The most notable premium watches have a sapphire crystal that is both scratch-resistant and durable. Check this replica rolex deal.

A luxury watch is very noticeable based on the weight of the watch, however, it is important to look out for fakes.

Watch Movement
The watch movement (otherwise known as the calibre) is the internal mechanism that drives all timekeeping functions of the watch. There are different types of watch calibre, with some considered more illustrious than others due to their precision and craftsmanship. There are two main types of movements: mechanical and quartz.

Whether manual or automatic, mechanical watches are considered to be more luxurious due to the craftsmanship and expertise required for their build. With intricate moving parts and incredible attention to detail, mechanical watches move in a fluid motion that watch enthusiasts consider a premium design.

You can find out more about watch movements and what they mean in our ultimate guide to watch movements.

PREMIUM WATCH FEATURES

Although the main function of a watch is to keep the time for a 24-hour day, luxury watches have additional features that give them their premium price points. The bezel, for example, can contain additional features, such as tachymeters, compasses and GMT time recorders to track time across different time zones.

Luxury watches are also suitable for extreme environments. State-of-the-art watches can be resistant to water for activities such as scuba diving and even space exploration activities, something you don’t quite get with most standard watches.

The Brand Name
The name engraved on the dial of a watch also has major implications on the price tag. Many of the most luxurious watchmakers have been around for hundreds of years, most noticeably those out of Switzerland. These brands have engraved their names in society as experts in watchmaking, as well as being a part of some of the most historical events to date. Additionally, as some of the most luxurious watch brands have been producing timepieces since the 1800s, they have been known for making highly precise, hard-wearing watches that will last a lifetime and more.

How To Get Luxury Watches At Affordable Prices?
Purchasing a luxury watch can be expensive. With the high-quality materials and the value that these brands hold, having the funds to get a luxury watch is beyond the reach of most. And even if you do have the funds, the waiting list for some of the brands is incredibly long. Due to this high demand and the length of time it takes to produce such technical, hand-made items, waiting lists for luxury watches can be as long as five years.

With all the complications that come with getting your hands on a brand-new luxury watch, it seems inevitable that the price will be unaffordable for most. However, there is a solution. The second-hand watch market is the perfect place to go to find a luxury watch without a waiting list and at a price which is easier on the wallet.

Tags: Confronti, Documenti, Guadagni, Scienza