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Utente Junior



518 Messaggi

Inserito il - 30 gennaio 2012 : 22:16:01  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di more more Invia a more more un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
sul libro questa cosa non c'è scritta e su internt trovo tutto e nulla :)

avrei bisogno una mano per capire la struttura del gene generica degli eucarioti
io ho scritto che il gene eucariotico è fatto cosi: 5'+ promotore +N°ngativo di basi +serie di basi trascritte e non tradotte + tratto di basi cariche positivamente ch +1 e poi c'è tutta la sequenza di esoni/introni + sequenza di termine (stop) + sequenza di basi trascritte e non tradotte

solo che io poi tra gli appunti di testo ho scritto che la trascrizione comincia in corrispondeza di una base trascritta e non tradotta come altre basi che seguno e poi una mia amica mi ha detto che lei a scritto ke il numero negativo nn è dopo il promotore, ma è il promotore ad avere una carica negativa..poi dopo c'è invece +1 dove inizia la sequenza di basi trascritta ma nn tradotta

come vedete ho un bel casino intesta e questa domanda secondo me c'è nel compito quindi chiedo aituo a voi

grazie a tutti!!

0barra1
Utente Senior

Monkey's facepalm

Città: Paris, VIIème arrondissement


3847 Messaggi

Inserito il - 31 gennaio 2012 : 00:10:12  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di 0barra1 Invia a 0barra1 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ma ti rendi conto che se si parla di nucleotidi tutti uguali tra loro (A G T C) parlare di cariche negative o positive è una sciocchezza?

So, forget Jesus. The stars died so that you could be here today.
A Universe From Nothing, Lawrence Krauss

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GFPina
Moderatore

GFPina

Città: Milano


8408 Messaggi

Inserito il - 31 gennaio 2012 : 00:17:08  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di GFPina  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di GFPina Invia a GFPina un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Non andare a dire una cosa del genere all'esame!!!
I numeri sono le posizioni relative dei vari elementi, la base da cui ha inizio la trascrizione è la +1 quelle dopo saranno +2, +3.... mentre quelle prima vanno in senso opposto e quindi hanno il numero negativo.
Questa è l'immagine della struttura di un gene eucariotico:


Dubito comunque che queste cose non siano scritte su un qualunque libro di biologia!
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0barra1
Utente Senior

Monkey's facepalm

Città: Paris, VIIème arrondissement


3847 Messaggi

Inserito il - 31 gennaio 2012 : 00:23:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di 0barra1 Invia a 0barra1 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da GFPina


Dubito comunque che queste cose non siano scritte ovunque



Fixed.



Comunque non farti confondere dal + e - assegnati alle basi: sono "coordinate", non cariche, come GFPina ha giustamente spiegato.

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Utente Junior



518 Messaggi

Inserito il - 31 gennaio 2012 : 11:12:08  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di more more Invia a more more un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
non lo so... sinceramente faccio fatica a capire se siano noi studenti che abbiamo scrittosbagliato, in quanto diciamo tutti "umero negativo o positivo di basi" poi sincermamente ha me sembrava strano che i nucleotidi avessero cariche positve però per scarsa autostima sono portato a credere che i miei appunti siano più sbagliati di quelli di altri..

quindi se ho capito bene

il gene è cosi

5' (con capuccio) ATAT(cioè sequenza ripetuta con cordinata negativa)+ + promotore + base con codinata più 1 + serie di basi con cordinate positive crescenti trascritte e non tradotte + sequenza di introni ed esoni + sequenza di termine (codone stopo) + basi trascritte e non tradotte + poli A 3'



ho capito bene? scusste l'ingoranza :)
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JGuardaGliUfo
Utente

Mafalda

Città: Roma


641 Messaggi

Inserito il - 31 gennaio 2012 : 14:40:10  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di JGuardaGliUfo Invia a JGuardaGliUfo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
sincermamente ha me


Forse volevi scrivere

Citazione:
a me


Premesso che hai già ricevuto due validissime risposte, da studentessa che prende tanti appunti ti dico che c'è un'enorme differenza tra dire (e capire) "numero negativo o positivo di basi" e "carica negativa". Capita a tutti di sbagliare nello scrivere appunti, così come capita di fraintendere concetti che non sono affatto facili: l'importante è chiarire e riflettere su quello che si è già (in passato) studiato.

I could not love except where Death
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E. A. Poe
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Utente Junior



518 Messaggi

Inserito il - 31 gennaio 2012 : 18:39:51  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di more more Invia a more more un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
sapevo già di mio che i nucleotidi hanno due cariche negative, essendo legati ad un gruppo fosfato
e inoltre sui miei appunti si vedeva che non erano cariche , perchè io sugli appunti ho scritto (sequenza negativa e non carica negativa,

prima di aprire questo post ne ho aperto uno sul gruppo classe face ricevendo risposte del tipo "non so se la carica negativa e del promotore o meno", Ho fatto la stessa domanda sul gruppo classe in face e ho avuto tre risposte diverse per quanto riguarda la posizione dei vari elementi del gene, in tutte però positivo e negativo venivano trattai come delle cariche e non come dei numeri o posizioni, quindi io ho cominciato ad avere un pò di confusione in testa e ho coretto i miei appunti cambiando "sequenza" con carica, sul nostro libro di testo il gene eucariotico non viene raffigurato e non trovavo un'immagine su internet e quindi ho chiesto qui

io volevo solo che qualcuno mi dicesse se era giusto l'ordine dei vari componenti del gene perche davvero il libro che è stato consigliato non le riportata, dice solo che al trascritto primario sono attaccati il cappuccio (7metilguanosina) al cinque primo e poliA al 3', riportando una figura che effettivamente indica che ci sono delle basi prima e dopo la sequenza codificante della proteina, però non riporta le cordonate e le non nominava nemmeno le sequenze ripetute, quindi l'immagine è incompleta e la prof a lezione la spiegata nel modo dovuto però diceva sempre "basi negative" o "numero negativo di basi", però non ha mai accennato le cordinate ed io non avevo mai sentito come la maggior parte dei miei compiangi credo

comunque tanto per essere chiari il libro consigliato è "elementi di biologia" quinta edizione della edises che come autori Solomon Berg e Martin ISBN 978-88-7959-474-5 e vi assicuro che è un libro TROPPO scadente, non riporta nemmeno le basi; ad esempio quando spiega la trascrizione e traduzione non riporta nemmeno la struttura dell'RNA polimerasi dei procarioti e non accenna ai vari tipi di RNA eucariotiche, come nella traduzione non spiega la funzione dei fattori di inizio dei procarioti (IF1 -IF2-IF3), quando parla della duplicazione dice che ci sono due DNA polimerasi, una per ogni filamento ma non dice che la DNA polimerasi che rimuove il primer e che corregge sono diverse, io l'ho letto sugli appunti e quindi poi ho cercato di capire meglio su internet

poi è vero io da studente del primo anno del primo semestre mi sono lascito trascinare dal atmosfera di Milano e sopravvalutato alcune mie conoscenze pregresse, nel senso credevo di ricordami meglio alcuni argomenti e poi ho scoperto, adesso o mentre studiavo chimica che alcune si erano sfumate

devo dire da come stanno andando le cose ho capito che forse dovevo darmi una svegliata in più a dicembre, cioè oltre a studiare istologia e anatomia che sono le materie che amo di più avrei dovuto fare anche un pò il resto



facendo questa domanda volevo che qualcuno dopo mi facesse capire se almeno la seconda volta avevo fatto giusto l'ordine perchè non era solo il fatto del cordonate e cariche, ma io nel primo post ho proprio stravolto l'ordine dei vari elementi

nel frattempo ho mandato una mail alla prof e per chiedere informazioni su questo gene, per capire l'ordine dei vari elementi del gene


ringrazio tutti per avermi fatto capire il fondamentale dettaglio delle cordonate, però quando su 3 persone che rispondono tutte dicono che i numeri sono cariche in quanto hanno il segno positivo o negativo


PS: siccome l'immagine non riporta la poliA e il cap io ho dovuto reinterpretare l'immagine e vorrei che qualcuono mi dicesse se ho capito bene, perchè la nostra prof avendo incluso questi dettagli nella struttura del gene peso che voglia che tutto sia riportato cosi, o meglio vuole l'immagine del trascritto primario, perchè poi una volta spiegato il disegno ha spiegato la traduzione

grazie a tutti


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Caffey
Utente Attivo

ZEBOV

Città: Perugia


1496 Messaggi

Inserito il - 31 gennaio 2012 : 19:27:04  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Caffey Invia a Caffey un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Il CAP e il Poli-A ce l'ha il segmento di mRNA che viene trascritto e non il gene presente nel genoma. Secondo me è scorrettissimo dire che un gene ha il CAP e il Poli-A.

[...] Hunc igitur terrorem animi tenebrasque necessest
non radii solis neque lucida tela diei
discutiant, sed naturae species ratioque. [...]

Titus Lucretius Carus
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JGuardaGliUfo
Utente

Mafalda

Città: Roma


641 Messaggi

Inserito il - 31 gennaio 2012 : 19:39:33  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di JGuardaGliUfo Invia a JGuardaGliUfo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sono d'accordo con Caffey. CAP al 5' e poli(A)al 3' sono modificazioni caratteristiche dell'mRNA. Forse, è stata fatta confusione con l'immagine allegata da GFPina: la freccia fucsia rappresenta l'RNA mentre viene polimerizzato e infatti, la dicitura Poly(A)site è in prossimiità della punta della freccia che è l'mRNA. Gli elementi costitutivi del gene eucariotico sono quelli del DNA (per capirci: la striscia celeste): il sito di inizio, designato con +1 e gli elementi a monte del sito.

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E. A. Poe
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Utente Junior



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Inserito il - 31 gennaio 2012 : 20:07:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di more more Invia a more more un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ho riletto il programma e c'è scritto generalità del gene eucaristico quindi hai ragione tu

quindi alla fine dovrebbe essere cosi

5'sequenze ripetute con cordinata negativa + promotore con cordinata negativa + "Più 1 dove inizia la base trascritta e non tradotte" + introni ed esoni + sequenza di termine + basi trascritte e non tradotte + sequenza consenso che dovrebbe essere AAUAAA 3'

ho scritto la sequenza rielaborando le cose da dette dai miei compagni sul gruppo studio, si sono aggiunte altre risposte perchè io alla fine mi sono fermato con la basi trascritte e non tradotte e non segnato il resto, poi come detto sul libro è riportato solo cosi:
5' basi sequenza codificante per la proteina segnale di termine (Tripletta stop) * basi 3'


però è molto meno dettagliato rispetto agli appunti di tutti

grazie ancora
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Giuliano652
Moderatore

profilo

Prov.: Brescia


6940 Messaggi

Inserito il - 31 gennaio 2012 : 20:15:56  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Giuliano652 Invia a Giuliano652 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da more more

ho riletto il programma e c'è scritto generalità del gene eucaristico quindi hai ragione tu




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Utente Junior



518 Messaggi

Inserito il - 31 gennaio 2012 : 20:16:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di more more Invia a more more un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
sono io che ho fatto confusione perchè mi ricordavo che la prof può chiedere anche la sequenza del trascritto primario

quindi se ho capito bene il trascrtto primario di fatto è uguale al gene, solo che ha il 5' legato al capuccio e l'estremità 3' legata alla coda poliA, giusto -inoltre la sequenza di basi trascritte (a velle del trascritto) ma non tradotte ha la sequenza di taglio, cioè la squenza che l'elicasi taglia prima dell'aggointa della poliA-

giusto perchè se cosi fosse basta ricordarsi come fatto il gene per risalire poi alla struttara del trascritto

grazie davvero!






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Utente Junior



518 Messaggi

Inserito il - 31 gennaio 2012 : 20:26:02  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di more more Invia a more more un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
scusate per l'errore di battitura


quindi alla fine il gene dovrebbe essere fatto cosi

5'sequenze ripetute con cordinata negativa + promotore con cordinata negativa + "Più 1 dove inizia la base trascritta e non tradotte" + introni ed esoni + sequenza di termine + basi trascritte e non tradotte + sequenza consenso che dovrebbe essere AAUAAA 3'

come detto ho rielaborato l'immagine con quello che è stato scritto dai miei colleghi sul gruppo classe in fb :) e poi se mi viene chiesto di scrivere il trascritto devo dire che al 5' è legata 7metilguanosina e al 3' la poliA e che la parte terminale, cioè quella vicino al 3' di basi trascritte e non tradotte ha la sequenza di taglio


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JGuardaGliUfo
Utente

Mafalda

Città: Roma


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Inserito il - 31 gennaio 2012 : 20:34:23  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di JGuardaGliUfo Invia a JGuardaGliUfo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Devi guardare attentamente le immagini e interpretarle secondo le direttive che ti sono state date qui; fin ad ora, scusami se te lo dico, ma non mi sembrano affatto chiari e corretti gli appunti dei tuoi compagni di corso.

Il gene eucariotico:

Immagine:

16,9 KB

mRNA eucariotico:

Immagine:

33,91 KB

Citazione:
"Più 1 dove inizia la base trascritta e non tradotte"


Che cosa volevi dire?

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0barra1
Utente Senior

Monkey's facepalm

Città: Paris, VIIème arrondissement


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Inserito il - 31 gennaio 2012 : 22:15:26  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di 0barra1 Invia a 0barra1 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da Giuliano652

Citazione:
Messaggio inserito da more more

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Scusate ma non ho resistito


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JGuardaGliUfo
Utente

Mafalda

Città: Roma


641 Messaggi

Inserito il - 31 gennaio 2012 : 22:46:44  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di JGuardaGliUfo Invia a JGuardaGliUfo un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
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Citazione:
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Messaggio inserito da Giuliano652


Citazione:
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Messaggio inserito da more more

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0barra1, anche tu!

Ho riso per mezz'ora. Senza offesa moremore. Può capitare a tutti!

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Martin.diagnostica
Utente Attivo

H. pylori



1582 Messaggi

Inserito il - 31 gennaio 2012 : 23:56:09  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Martin.diagnostica Invia a Martin.diagnostica un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
eccolo qui il gene eucaristico



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M111
Utente

Pleiadi

Prov.: Lucca
Città: Guamo


838 Messaggi

Inserito il - 01 febbraio 2012 : 11:43:22  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di M111 Invia a M111 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ahahahahaha
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Daria85
Utente

aplisia



678 Messaggi

Inserito il - 01 febbraio 2012 : 12:21:59  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Daria85 Invia a Daria85 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ahaah troppo bello! :'D
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Daria85
Utente

aplisia



678 Messaggi

Inserito il - 01 febbraio 2012 : 13:27:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Daria85 Invia a Daria85 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
cmq sono certa ke in qualsiasi libro di biologia o biologia molecolare(ancora meglio) potrai trovare tutte le risposte!
ma nn ne avete uno su cui stud consigliato dal prof?
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Utente Junior



518 Messaggi

Inserito il - 01 febbraio 2012 : 14:31:52  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di more more Invia a more more un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
oggi ho cominciato a ripassare genetica e ho cominciato a capire di più, gli appunti dei miei compagni hanno tutti lo stesso stile, fin'ora mi avranno risposto in 5-6 persone

grazie a tutti per le risposte

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0barra1
Utente Senior

Monkey's facepalm

Città: Paris, VIIème arrondissement


3847 Messaggi

Inserito il - 01 febbraio 2012 : 14:50:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di 0barra1 Invia a 0barra1 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Tornando pesantement IT, le basi trascritte a monte del sito di inizio traduzione non sono ovviamente tradotte.
Al 5' della tripletta di START dell'mRNA si trova invece una regione nell'ordine di qualche centinaio di basi a cui appartengono sequenze riconosciute da proteine coinvolte nella regolazione della stabilità del messaggero e della sua traduzione. Sempre in questa stringa di nucleotidi si trova spesso quella che prende il nome di sequenza di Kozak, la quale di fatto permette all'apparato ribosomiale di riconoscere e "attraccare" sull'mRNA. Da qui, muovendosi verso il 3' del trascritto, il ribosoma incontrerà lo START codon ed incomincerà la traduzione.
Complessivamente tale stringa di nucleotidi prende il nome di 5' UTR, da UnTraslated Region.

Di nuovo, come il saggio Caffey notava per il 5mCit cap, si parla di UTR in riferimento all'mRNA, anziché al gene.

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Utente Junior



518 Messaggi

Inserito il - 01 febbraio 2012 : 16:23:27  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di more more Invia a more more un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie davvero!!

adesso ho capito tutto!

la mia prof non la spiegato cosi, lei si è messa semplicemente a disegnare una riga alla lavagna e la divisa in segmenti, dicendo qui c'è il promotore, poi le basi non trascritte e non tradotte ecc.. dicendo che poi in biologia molecolare avremmo approfondito

un utente prima diceva che secondo lui gli appunti non erano chiari, sinceramente lo credo anch'io però la prof ha spiegato il gene usando lo stile dei miei compagni

un'altra domanda se permettete :) anche questa per voi forse sarà una sciocchezza:


la mia prof di biologia delle superiori diceva sempre che la sintesi proteica si compone di due fasi: trascrizione e traduzione ed anche il libro di testo che usavamo trasmetteva questo concetto, però leggendo gli appunti e anche su wiki viene detto che in realtà la sintesi proteica comprende solo la sintesi della proteina partendo dal RNAm, cioè si compone solo della traduzione

quindi mi chiedo se è più coretto dire che la sintesi proteica comprende trascrizione e traduzione, oppure solo la traduzione?
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Giuliano652
Moderatore

profilo

Prov.: Brescia


6940 Messaggi

Inserito il - 01 febbraio 2012 : 16:41:49  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Giuliano652 Invia a Giuliano652 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
beh, non c'è traduzione di mRNA senza trascrizione, ma i biologi in genere tendono a separare le cose perché ogni processo è a sé stante, con enzimi diversi, in tempi diversi, con passaggi intermedi...

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Inserito il - 01 febbraio 2012 : 16:42:26  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di 0barra1 Invia a 0barra1 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Io l'ho sempre vista
TRASCRIZIONE : sintesi dell'RNA
TRADUZIONE: sintesi della proteina.

Anche se le due sono tutto fuorché slegate.

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Utente Junior



518 Messaggi

Inserito il - 01 febbraio 2012 : 21:30:53  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di more more Invia a more more un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie a tutti per le risposte!!


Alla fine la prof di biologia ha risposto alla mia mail (gli ho scritto se era giusta questa sequenza del trascritto del trascritto primario

5' (con capuccio) ATAT(cioè sequenza ripetuta con cordinata negativa)+ promotore + base con codinata più 1 + serie di basi con cordinate positive crescenti trascritte e non tradotte + sequenza di introni ed esoni + sequenza di termine (codone stopo) + basi trascritte e non tradotte + poli A 3'

e lei mi ha risposto "Gentile sig Moreno
lei ha capito perfettamente
la sequenza da lei riportata è molto più completa completa di quella che abbiamo fatto a lezione
che le riassumo qua
5' (con capuccio) )+ promotore 1 + serie di basi trascritte e non tradotte + sequenza di introni ed esoni + sequenza di termine (codone stopo) + basi trascritte e non tradotte + poli A 3'
buona giornata
L.D. (non metto il nome per la privacy)


se nel compito lei chiede di scrivere il GENE tutto rimane uguale, però bisogna togliere poli A e cap? giusto?

PS vorrei far notare che la prof insegna a TLB del primo anno - se fosse stata una classe del secondo anno, oppure una prima di biotech/biologia l'avrebbe spiegata in modo simile a 0barra1 credo :)
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