Bioinformatica e Web 2.0

Inside Bioinfo

10 dicembre 2007 - 16:50

Moleculat Mat (nuovo progettino didattico)

Oggi vorrei fare una mini dichiarazione d’intenti, e far partire una nuova iniziativa: un progetto un attimo più ambizioso, che sia in grado di dare un valore più duraturo ai post che scrivo.

Troppo spesso ci si dimentica degli aspetti più “teorici” su cui si fonda la bioinformatica. Essa sfrutta, nei vari settori, tanti altri interessantissimi approcci matematico-computazionali.
A dimostrazione si vada a leggere l’indice dell’ultimo numero di Bioinformatics (anche solo l’indice è galvanizzante): strategie predittive, algoritmi genetici, clustering, alberi gerarchici, support-vector-machine…
Non c’è solo la statistica! :-) La cristallografia, la system biology, la filogenetica si legano spesso indissolubilmente a questi argomenti! E alle volte non li sfruttano ancora a pieno, secondo la mia modesta opinione.

In effetti, le necessità di alte prestazioni computazionali, che distinguono molti aspetti della bioinformatica, comportano lo sviluppo di tool che hanno fondamenta teoriche di grande fascino.

In quest’ottica vorrei proporre delle piccole escursioni nelle basi di questi interessanti argomenti. Per quanto possa; e nel caso non avessi proprio competenza per introdurre un argomento, cercherò di coivolgere altri con piccole ma intense collaborazioni. Cercherò, inoltre di strutturare gli argomenti secondo diversi aspetti che andranno completandosi vicendevolmente. Nel blog vi proporrò i soliti post, descrizioni che diano una visione a grandi linee. Insieme ad esso metterò a disposizione su slideshare delle presentazioni powerpoint che siano più incisive e configurino l’argomento in modo più rigoroso.
Infine verrà proposto una relazione più completa che cerchi di ampliare ancor di più l’argomento, portare esempi pratici
e via dicendo…

In attesa di integrare tutti questi aspetti nel laboratorio di molecular lab, ho aperto un nuovo blog-collector a base wordpress: MOLECULAR MAT (inteso come “molecular material“).
Per iniziare ho realizzato una escursione “beta-version” sugli alberi dei suffissi, furteggiando di qui e di là in rete. :-)

Spero che lo sforzo possa essere gradito.

Ciao a tutti

Tags: bioinformatica, Collaborazione, Didattica, MolecularMat, Progetto