Bioinformatica va di pari passo con perl. Questo è un dato di fatto se non quasi un assioma. Di recente ci si è resi conto che perl, nonostante le sue interessanti potenzialità per quanto riguarda la gestione delle stringhe, è totalmente inadeguato quando s’ha da affrontare qualcosa che ha a che fare con i numeri. […]
Bioinformatica e Web 2.0
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Non solo perl
Librerie di oggetti bioinformatici Python (metalinguaggi da laboratorio da condividere)
Sul suo blog personale, Dalloliogm ha scritto un interessante articolo su come python può facilitare la vita dei bioinformatici . Il suo è un bel esempio di come, attraverso una serie di oggetti legati alla genetica, alle banche dati, ecc, è possibile creare una libreria sempre pronta per elaborazioni comode e veloci: un meta linguaggio […]
Dove e’ il podcast (audio) bioinformatico?
Il nuovo fantasma nella macchina di internet è ormai un file avi. Sì, è un’immagine video sfuocata, amatoriale, che mostra i contorni sbiaditi di una cantina ipertecnologica. La mitologia di ogni studio televisivo pirata: il video che entra ovunque, con un click su you tube, magari per 20 secondi, azzanna un concetto e si spegne […]
Biomail è morto (o quasi), lunga vita a Biomail
Cosa è Biomail? BioMail è un programma sviluppato in Perl che semplifica e automatizza la ricerca della letteratura scientifica. BioMail in sostanza effettua ricerche su PubMed, la piu’ grande banca dati pubblicamente disponibile per riviste biomediche, attraverso l’uso di parole chiave definibili dall’utente. I risultati vengono poi inviati tramite posta elettronica con una cadenza settimanale, […]
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