Bioinformatica e Web 2.0

Inside Bioinfo

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Spettrometria di massa Natalizia (lista dei desideri dei big boss della proteomica)

» di 30 novembre 2007 - 11:54 » Comments (1)

Pare proprio che qualche redattore di Nature Method abbia anche un lato goliardico! Ad accesso gratuito è apparso -nel nuovo numero- un articolo tra il serio e il faceto sulle potenzialità della spettrometria di massa applicata alla proteomica: Mass spectrometry: playing catch up. A parte la presenza delle opinioni dei maggiori protagonisti del settore, questo […]



GALAXY (finalmente la genomica for dummies!)

» di 22 novembre 2007 - 13:56 » Comments (2)

Una nuova spettacolare piattaforma è ora disponibile per ogni bioinformatico pigro (categoria sempre piu’ corposa) Galaxy è un nuovo servizio che fa faville per comodità, portabilità e utilizzo. Fate attenzione Galaxy da’ dipendenza. Non è semplicemente un altro tool, è invece un nuovo approccio vero e proprio all’analisi dei dati genomici. Di cosa si tratta? […]



The DNA Network (un occhio di sbieco sul mondo della science-blog-sphere)

» di 21 novembre 2007 - 17:11 » Comments (1)

Un problema notevole in un mondo dove la blogsfera è infinitamente in crescita, infinitamente veloce, è selezionare cosa leggere, e sapere dove trovare quanto di interessante c’è in un determinato settore. I semplici aggregatori feed possono aiutare, ma spesso sono dispersivi. La mia pagina personale del google desktop, per esempio, ormai si dispone in 4 […]



Bioscreencast (1001 nuovi sharing tools)

» di 12 novembre 2007 - 18:20 » Comments (2)

Il successo di YouTube ha veramente rivoluzionato il web e la sua anima collaborativa. Oramai tutti i giorni si scoprono nuovi progetti che integrano web 2.0 con lo streaming e dintorni. Ci sono radio via web e portali per condividere slide e presentazioni, ci sono gruppi su social networks, ci sono sistemi televisivi personalizzabili, e […]



Sono solo dati, stupido! (i limiti di OpenSocial)

» di 10 novembre 2007 - 12:02 » Comments (0)

Torno brevemente sulla questione della necessità che i dati siano condivisi e condivisibili, sopratutto in ambienti scientifici. Nell’articolo su Genome Commons facevo notare come ci sia ben da sperare se nascono iniziative spinte dalla filosofia della condivisione e divulgazione della conoscenza (anche iper-specialistica). Ebbene, c’è anche chi non va proprio in questa direzione (o almeno […]



Progetto bioSapiens (corsi e dintorni)

» di 9 novembre 2007 - 11:09 » Comments (0)

Su Cordis , un altro interessante articolo punta il dito sull’importanza della bioinformatica. Si parla del progetto BioSapiens, un altro di quegli enormi aglomerati di istituti europei attorno a una progetto troppo grosso per essere condotto da un singolo istituto. Queste join venture scientifiche saranno anche di moda (perchè fanno circolare una buona quantità di […]



Genome Commons (Farsi il genoma da soli)

» di 6 novembre 2007 - 15:03 » Comments (3)

Ricordo quando anni fa incontrai per la prima volta la parola “Commons” insieme a “proteomica”. Proteomecommons fu un sito di grande interesse. Lo si sarebbe dovuto mettere su un piedistallo solo per 2 aspetti: distribuivano l’archivio dei dati e dei tool via torrent, e avevano realizzato la geniale trovata della fetta di torta che viene […]