Bioinformatica e Web 2.0

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Spettrometria di massa Natalizia (lista dei desideri dei big boss della proteomica)

» di 30 novembre 2007 - 11:54 » Comments (1)

Pare proprio che qualche redattore di Nature Method abbia anche un lato goliardico! Ad accesso gratuito è apparso -nel nuovo numero- un articolo tra il serio e il faceto sulle potenzialità della spettrometria di massa applicata alla proteomica: Mass spectrometry: playing catch up. A parte la presenza delle opinioni dei maggiori protagonisti del settore, questo […]



Progetto bioSapiens (corsi e dintorni)

» di 9 novembre 2007 - 11:09 » Comments (0)

There is talk of the project BioSapiens , another of those huge agglomerations of European institutions around a project too big to be conducted by a single institution. These scientific joint ventures will also be in fashion (because they circulate a good amount of funding), but they also fulfill a fundamental task, which is often […]



Genome Commons (Farsi il genoma da soli)

» di 6 novembre 2007 - 15:03 » Comments (3)

Ricordo quando anni fa incontrai per la prima volta la parola “Commons” insieme a “proteomica”. Proteomecommons fu un sito di grande interesse. Lo si sarebbe dovuto mettere su un piedistallo solo per 2 aspetti: distribuivano l’archivio dei dati e dei tool via torrent, e avevano realizzato la geniale trovata della fetta di torta che viene […]



Piccolo momento di autocoscienza bioinformatica (per non sforzare i neuroni)

» di 15 ottobre 2007 - 17:35 » Comments (2)

Quando leggo o sento parlar di scienza in Italia, di come essa sia il futuro del paese (dell’umanità!), e di come siamo tutti tanto orgogliosi del nobel assegnati ai nostri migliori cervelli, non so mai se sorridere o piagnucolare. Inanzitutto perchè subito mi tornano in mente i valori dei finanziamenti che vengono investiti nel nostro […]



Scienza, studi e ricerche spiegati in video

» di 10 settembre 2007 - 14:48 » Comments (0)

Altrove se ne è già parlato, uno tra tutti vi cito l’articolo su bioinfo Blog! E quindi vi indico solo l’uscita di un nuovo articolo sulla Repubblica online che discute delle grandi potenzialità del nuovo sito di scivee.tv per quanti siano interessati ad approfondire argomenti scientifici via video.



Lo strano caso degli standard scientifici (e dei bizzarri inglesi)

» di 31 agosto 2007 - 10:39 » Comments (0)

Ultimamente il mio lavoro bioinformatico si è spostato da una consistente ideazione di algoritmi e implementazione software ad una maggiore attenzione alla standardizzazione dei dati e dei risultati, vista l’approssimarsi della submission di un articolo. Mi sono guardato un po’ in giro e ho avuto un attacco di panico. Come è possibile che all’alba del […]



In arrivo la beta di MyExperiment!

» di 22 luglio 2007 - 13:08 » Comments (0)

myExperiment é un progetto di cui si parla da un po’ di tempo, che si propone di mettere a disposizione della comunità scientifica uno strumento simile a quello che é mySpace. Ovvero, un luogo in cui un ricercatore possa iscriversi e creare un proprio profilo, descrivere i propri interessi e il proprio curriculum, poter interagire […]



Dove e’ il podcast (audio) bioinformatico?

» di 12 luglio 2007 - 17:23 » Comments (2)

Il nuovo fantasma nella macchina di internet è ormai un file avi. Sì, è un’immagine video sfuocata, amatoriale, che mostra i contorni sbiaditi di una cantina ipertecnologica. La mitologia di ogni studio televisivo pirata: il video che entra ovunque, con un click su you tube, magari per 20 secondi, azzanna un concetto e si spegne […]



Meglio un bioinformatico biologo o un biologo bioinformatico?

» di 2 luglio 2007 - 16:09 » Comments (2)

(as Gene Myers suggested be really good computationalist, and even he says that computer scientists should learn science, too. And of course statistics! We all need to know statistics.) Una questione non nuova, e che spesso si ripropone in varie forme, è quella che mette ai due angoli del ring le diverse anime del bioinformatico. […]



GPU Computing

» di 25 giugno 2007 - 10:49 » Comments (0)

Non so se ve ne siete accorti, negli ultimi tempi non si parla d’altro:GPU computing. Ma cosa significa GPU computing? Essenzialmente si tratta di demandare routine di calcolo alla GPU (Graphics Processing Unit), ovvero il processore della vostra scheda video. Ci sono svariati motivi per cui si è intrapresa questa via. Il primo, e probabilmente […]