Bioinformatica e Web 2.0

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Editor di sequenze: CLC Sequence Viewer

» di 16 dicembre 2008 - 20:04 » Comments (2)

Un editor di sequenze è un programma in grado di manipolare con facilità sequenze nucleotidiche e proteiche. Il primo dei programmi che ho intenzione di presentarvi è CLC Sequence Viewer che è arrivato alla versione 5.1.1 Il programma è creato dalla CLC bio, che permette il download e l’utilizzo gratis, indubbiamente presenta una grafica molto […]



Nuovo autore in InsideBioinfo…

» di 17 settembre 2008 - 19:13 » Comments (6)

Ciao a tutti, da oggi InsideBioinfo ha un nuovo autore…me Sono Domenico, sto frequentando la Specialistica in Biotecnologie Mediche, e ho una passione per l’informatica e (ovviamente) per la Biologia…inutile dire quindi della mia passione per la BioInformatica, alla quale però mi sono avvicinato relativamente da poco. Devo dire che sono un po’ emozionato a […]



Una biblioteca di PDF scientifici (per Mac ma non solo)

» di 13 febbraio 2008 - 11:45 » Comments (12)

Fabrizio Capuani mi segnala “Papers“, interessante software, per mantenere e gestire le proprie collezioni di articoli. Essendo solo disponibile per Mekentosjani, non l’ho potuto testare, quindi spero in qualche altra opinione. Personalmente, come fervente utilizzatore di Windows, ho sempre fatto ricorso ad Endnote. Endnote si differenzia da Papers per la capacità di integrarsi con Word […]



The DNA Network (un occhio di sbieco sul mondo della science-blog-sphere)

» di 21 novembre 2007 - 17:11 » Comments (1)

Un problema notevole in un mondo dove la blogsfera è infinitamente in crescita, infinitamente veloce, è selezionare cosa leggere, e sapere dove trovare quanto di interessante c’è in un determinato settore. I semplici aggregatori feed possono aiutare, ma spesso sono dispersivi. La mia pagina personale del google desktop, per esempio, ormai si dispone in 4 […]



Sono solo dati, stupido! (i limiti di OpenSocial)

» di 10 novembre 2007 - 12:02 » Comments (0)

Torno brevemente sulla questione della necessità che i dati siano condivisi e condivisibili, sopratutto in ambienti scientifici. Nell’articolo su Genome Commons facevo notare come ci sia ben da sperare se nascono iniziative spinte dalla filosofia della condivisione e divulgazione della conoscenza (anche iper-specialistica). Ebbene, c’è anche chi non va proprio in questa direzione (o almeno […]



openbiosource.org: progetto bioinformatico italiano

» di 17 ottobre 2007 - 23:52 » Comments (2)

Diamo il benvenuto ad un altro progetto che si propone di creare un luogo di incontro e di discussione per i bioinformatici e biologi italiani: openbiosource.org Si tratta di un progetto decisamente innovativo e interessante, che mette a disposizione un forum e diversi link utili a chiunque abbia bisogno di discutere di problematiche relative all’uso […]



I 7 peccati capitali commessi dai bioinformatici.

» di 29 luglio 2007 - 18:33 » Comments (6)

Stavo leggendo questo post su nodalpoint, in cui si commentava un talk presentato all’ultimo Bioinformatic Open Source Conference (come mi piace questo nome) a Vienna, una settimana fa. Si parla degli errori piu’ grandi commessi dalla comunita’ bioinformatica moderna, e onestamente, mi trovo d’accordo su molti punti. Ecco le slides: http://www.slideshare.net/dullhunk/the-seven-deadly-sins-of-bioinformatics/ Vediamo un po’, di […]



L’integrazione della complessità. Una interessante analisi

» di 7 giugno 2007 - 16:01 » Comments (0)

All’interno delle varie aree del sito del bioindustry park Canavese, è possibile leggere un documento molto interessante del 2006, che traccia un quadro complessivo e molto ben fatto dello stato della bioinformatica. Si intitola: la sfida della bioinformatica: l’integrazione della complessità. Consiglio l’ottima relazione di Alberto Baldi e Fabrizio Conicella sia a coloro che di […]