Bioinformatica e Web 2.0

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Disegnare velocemente Primer con CLC…

» di 24 marzo 2009 - 19:59 » Comments (0)

Differentiating Between Natural and Synthetic Nootropics In the world of nootropics, there are two main categories: natural compounds derived from plants and synthetic drugs created in laboratories. Understanding the differences between these options can help individuals make informed choices here https://www.timesunion.com/. Natural Nootropics: Traditional Use without Extensive Research Natural nootropics are often derived from herbs […]



Bio-Linux Live DVD

» di 5 marzo 2008 - 15:46 » Comments (5)

Letto l’articolo su Programmazione.it su Bio-Linux, una distribuzione per bioinformatici, e presa l’occasione di dover rasare il Dell di mio padre, ho sostituito un dolce Ubuntu che stava andando ininterrottamente senza problemi da 132 giorni con BioLinux, ovvero una distribuzione base Debian per Bioinformatici. Per saperne di più vi rimando all’articolo di Francesco Corsentino sopra […]



Gene Characterization Index (CGI? what’s up!)

» di 15 febbraio 2008 - 11:09 » Comments (0)

“Uno score per indicizzare il livello di caratterizzazione dei geni” Prima o poi chi gioca al Bioinformatico si ritrova ad affrontare la sfida di progettare un sistema di indicizzazioine e scoring. Ce ne sono di ogni tipo, possono esserci score statistici, algoritmici, induttivi, euristici, gerarchici… ci si perde facilmente tra curve poissoniane del rumore, condizioni […]



Una biblioteca di PDF scientifici (per Mac ma non solo)

» di 13 febbraio 2008 - 11:45 » Comments (12)

Fabrizio Capuani mi segnala “Papers“, interessante software, per mantenere e gestire le proprie collezioni di articoli. Essendo solo disponibile per Mekentosjani, non l’ho potuto testare, quindi spero in qualche altra opinione. Personalmente, come fervente utilizzatore di Windows, ho sempre fatto ricorso ad Endnote. Endnote si differenzia da Papers per la capacità di integrarsi con Word […]



La proprietà transitiva della Bioinformatica

» di 30 gennaio 2008 - 17:37 » Comments (2)

La bioinformatica ha speso negli anni molti sforzi intorno il pattern detection, per ovvii motivi. Il pattern matching è infatti una delle grandi anime della bioinformatica; è usato, dove più dove meno, ovunque, negli allineamenti multipli, nel homology modeling, per classificazioni e per predizioni, in proteomica come in genomica. Non è una notizia nuova che […]



GALAXY (finalmente la genomica for dummies!)

» di 22 novembre 2007 - 13:56 » Comments (2)

Una nuova spettacolare piattaforma è ora disponibile per ogni bioinformatico pigro (categoria sempre piu’ corposa) Galaxy è un nuovo servizio che fa faville per comodità, portabilità e utilizzo. Fate attenzione Galaxy da’ dipendenza. Non è semplicemente un altro tool, è invece un nuovo approccio vero e proprio all’analisi dei dati genomici. Di cosa si tratta? […]



The DNA Network (un occhio di sbieco sul mondo della science-blog-sphere)

» di 21 novembre 2007 - 17:11 » Comments (1)

Un problema notevole in un mondo dove la blogsfera è infinitamente in crescita, infinitamente veloce, è selezionare cosa leggere, e sapere dove trovare quanto di interessante c’è in un determinato settore. I semplici aggregatori feed possono aiutare, ma spesso sono dispersivi. La mia pagina personale del google desktop, per esempio, ormai si dispone in 4 […]



Bioscreencast (1001 nuovi sharing tools)

» di 12 novembre 2007 - 18:20 » Comments (2)

Il successo di YouTube ha veramente rivoluzionato il web e la sua anima collaborativa. Oramai tutti i giorni si scoprono nuovi progetti che integrano web 2.0 con lo streaming e dintorni. Ci sono radio via web e portali per condividere slide e presentazioni, ci sono gruppi su social networks, ci sono sistemi televisivi personalizzabili, e […]



Protein ID mapping (come passar da una nomenclatura ad un’altra in due facili click)

» di 17 ottobre 2007 - 10:16 » Comments (1)

Chiunque abbia lavorato con le proteine in silico non può che rendersi conto di quanto sia un pandemonio gestirne la nomenclatura. La loro complessità disperde la ricerca in mille rivoli; la varietà dei progetti che nascono e i database che ne derivano hanno un tratto in comune: non avere un gran che in comune. Tanto […]



gli strumenti indispensabili per il bioinformatico (poco) scaltro

» di 3 ottobre 2007 - 09:25 » Comments (4)

L’idea da cui ero partito per questo articolo era cercare di configurare delle macro-aree di bioinformatica, e per ognuna di esse collezionare i software e gli strumenti on line che un buon bioinformatico non può non conoscere. Un po’ troppo ambizioso, naturalmente. Inanzitutto perchè non è facile individuare delle categorie ben chiare ove collocare questa […]